課程資訊
課程名稱
 生物資訊學
BIOINFORMATIC 
開課學期
 97-2 
授課對象
 生命科學院  生命科學系  
授課教師
 阮雪芬 
課號
 LS3005 
課程識別碼
 B01 31050 
班次
  
學分
 2 
全/半年
 半年 
必/選修
 必修 
上課時間
 星期二5,6(12:20~14:10) 
上課地點
 生科4B 
備註
 Ｂ群選擇必修。最好曾修過分子生物學或生物化學。與林仲彥合開
限學士班三年級以上
總人數上限：60人 
Ceiba 課程網頁
 http://ceiba.ntu.edu.tw/972bi 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
 核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程主在介紹現今在生物資訊領域的相關知識. 課程內容包括: Introduction, Biological Databases, Analysis at the Nucleotide and Protein Level, Inferring Relationships等
1. Introduction
2. Biological Databases I: Sequence Databases
3. Biological Databases II: Mapping Databases
4. Biological Databases III: Information Retrieval from Biological Databases
5. Analysis at the Nucleotide Level I: Predictive Methods Using DNA Sequences
6. Analysis at the Nucleotide Level II: Predictive Methods Using RNA Sequences
7. Analysis at the Nucleotide Level III: Sequence Polymorphisms
8. Analysis at the Protein Level I: Predictive Methods Using Protein Sequences
9. Analysis at the Protein Level II: Protein Structure Prediction and Analysis
10. Analysis at the Protein Level III: Intermolecular Interactions and Biological Pathways
11. Inferring Relationships I: Assessing Pairwise Sequence Similarity: BLAST and FASTA
12. Inferring Relationships II: Creation and Analysis of Protein Multiple Sequence Alignment
13. Inferring Relationships III: Phylogenetic Analysis
14. Inferring Relationships IV: Using DNA Microarrays to Assay Gene Expression
15. Inferring Relationships V: Proteomics and Protein Identification
16. Drug Discovery and Bioinformatics
 

課程目標
 希望訓練學生利用生物資訊工具及知識進行其它課程的資料收集及分析 
課程要求
  
預期每週課後學習時數
  
Office Hours
  
指定閱讀
  
參考書目
  
評量方式
(僅供參考)
    
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
 2 月17 日   Introduction (阮雪芬) 
第2週
 2 月24 日   Biological Databases I: Sequence Databases (阮雪芬) 
第3週
 3 月03 日   Biological Databases II: Mapping Databases (阮雪芬) 
第4週
 3 月10 日   Biological Databases III: Information Retrieval from Biological Databases (阮雪芬) 
第5週
 3 月17 日  Biological Databases IV: Genomics Databases & Analysis at the Nucleotide Level I: Predictive Methods Using DNA Sequences (阮雪芬) 
第6週
 3 月24 日  Analysis at the Nucleotide Level II: Predictive Methods Using RNA Sequences (阮雪芬) 
第7週
 3 月31 日  Analysis at the Nucleotide Level III: Sequence Polymorphisms (阮雪芬) 
第8週
 4 月07 日  Application of Bioinformatics to Biomedical Research (阮雪芬) 
第9週
 4/14  期中考週 
第10週
 4 月21 日  1.Surfing Skills on the Ocean of Bioinformatics.
2.Analysis at the Protein Level I: Predictive Methods Using Protein Sequences (林仲彥) 
第11週
 4 月28 日  Analysis at the Protein Level II: Protein Structure Prediction and Analysis (林仲彥) 
第12週
 5 月05 日  Analysis at the Protein Level III: Intermolecular Interactions and Biological Pathways (林仲彥) 
第13週
 5 月12 日  Inferring Relationships I: Assessing Pairwise Sequence Similarity: BLAST and FASTA (林仲彥) 
第14週
 5 月19 日  Inferring Relationships II: Creation and Analysis of Protein Multiple Sequence Alignment (林仲彥) 
第15週
 5 月26 日  Inferring Relationships III: Phylogenetic Analysis (林仲彥) 
第16週
 6 月02 日  Inferring Relationships IV: Using DNA Microarrays to Assay Gene Expression (林仲彥) 
第17週
 6 月09 日  Inferring Relationships V: Proteomics and Protein Identification (林仲彥) 
第18週
 6 月16 日  期末考週